有些人认为麻辣烫是一种不健康的食物，或许更多的是因为它出身卑微，价钱低廉，担心其食品安全。实际上，如果能够在原材料安全和加工卫生方面把好关，并进行合理的搭配，麻辣烫说得上是一种相当不错的快餐食品，比煎炸食品要健康得多，也环保得多。
首先，东北的清水麻辣烫并麻辣适中，多放些芝麻酱，它是非常健康的一种调料，富含钙和维生素e。或者可以适量加入蒜汁，还有杀菌作用。 而且辣椒每百克辣椒维生素C含量高达198毫克，居蔬菜之首位。维生素B、胡萝卜素以及钙、铁等矿物质含量亦较丰富。医药专家认为，辣椒能缓解胸腹冷痛，制止痢疾，杀抑胃腹内寄生虫，控制心脏病及冠状动脉硬化；还能刺激口腔粘膜，引起胃的蠕动，促进唾液分泌，增强食欲，促进消化。
其次清水麻辣烫通常有多种绿叶蔬菜，有多种豆制品原料，有海带等藻类，有蘑菇等菌类，有薯类等相比之下，植物性原料品种占优势。只要合理搭配，它比一般的快餐菜肴更易达到酸碱平衡的要求，也符合食物多样化的原则。
第三，麻辣烫的加热温度并不高，也不会产生油烟和脂肪高温氧化问题。和高温烹炒相比，对空气环境污染较小。 而且，即烫即食的加工过程中，不用任何老汤底料，如此不会产生任何的嘌呤有害物质的摄入。涮菜的过程中可以去除蔬菜中的部分草酸、亚硝酸盐和农药，虽然损失一部分维生素c，但也减少了抗营养因素和有毒物质。只要注意定期更换涮菜水，涮的过程中少加盐，就是非常好的烹调方式。
最后，清水麻辣烫的调料可以做到健康低脂。涮菜的时候没有放油，调拌的时候也可以按照顾客的要求减少放辣油，总体来说，原料含脂肪少，热量比较低。相比之下，炒菜的时候，往往要经过滑油、烹炒、淋明油三个加油过程，而且顾客无法选择菜肴的放油量。
食用麻辣烫，只要注意以下几点，就能在营养平衡方面达到较好的效果：
——新鲜蔬菜和菌类、豆制类等的比例达到2：1，促进酸碱平衡。实际上，这一点很容易做到。
——增加食物品种，多选蘑菇、海带、豆制品等食物。
——少放一点盐和味精，辣椒也要适量。
——放入芝麻和花生酱，增加钙的摄入量。
——放些有杀菌作用的蒜汁和醋，或者吃点生大蒜，帮助预防肠道感染。
